Benteng Belgica dibangun oleh VOC sebagai pertahanan bagi Benteng Nassau yang selalu di serang oleh masyarakat Banda yang melakukan perjuangan perlawanan terhadap VOC. Benteng Belgica berada di atas bukit di tengah Pulau Neira, sebelum ada Benteng Belgica, masyarakat Banda menyerang Benteng Nassau dengan sangat mudah dari atas bukit ini menggunakan panah-panah api. Pada awal pembangunan benteng ini pada tahun 1611 hanya berupa pos kecil. Kemudian secara bertahap pada tahun 1660 dan 1673, Benteng Belgica ini dibangun oleh VOC hingga bentuknya yang sekarang. Benteng ini pernah direbut oleh Inggris yang mengalahkan VOC pada tahun 1796.